再生障碍性贫血经过合适的治疗可以带病生存很多年，但是急性重症再生障碍性贫血的预后较差。
绝大多数的再生障碍性贫血是慢性的，患者在经过积极的治疗后缓解率是很高的，存活率也是很高的，只有极少数发展为急性重型再障。急性再障会出现全血细胞的快速减少，患者会出现感染、出血等症状，可能会导致死亡，通过使用免疫抑制剂和对症治疗，约有一半以上的患者可以缓解，但是还有一小部分患者可能在一年内死亡。
再障的预后整体较好，但是要积极治疗，防止发展为急性再障。
