尖锐湿疣出现复发时应及时进行治疗。由于目前并没有针对尖锐湿疣特效的抗病毒药物，因此尖锐湿疣者应采取综合治疗。主要治疗原则为去除局部疣体，还应该尽可能消除疣体周围的亚临床感染。尖锐湿疣的患者大部分经过有效治疗后可达到治愈目的，但部分患者的皮肤黏膜内的HPV病毒可能会长期存在，导致本病容易复发。
尖锐湿疣的患者在治疗期间需要避免性生活，如果性伴侣也有尖锐湿疣，则需要共同进行治疗。还应注意局部卫生，对于被分泌物污染的衣物，需要及时进行消毒处理。
