在临床当中，乳腺癌做FISH检测，主要是为了判断肿瘤的性质，以及为患者后续的治疗提供一定的依据，方便医生指导用药。
乳腺癌FISH检查主要是用于检测乳腺癌组织中HER-2基因的表达程度，HER-2基因是乳腺癌分子靶向治疗重要靶标，所以FISH检查可以对乳腺癌后续的靶向治疗提供依据。
乳腺癌患者FISH检测结果为阳性时，表示HER-2为阳性，患者在接受手术治疗后还需要配合靶向药物治疗。另外，HER-2还是判断乳腺癌预后良好情况的最重要指标。
