脊髓空洞症不能完全治愈，而且目前尚无特效疗法，临床上主要是以对症治疗，在早期通过手术可最大限度减少功能缺陷，获得更好的预后，但手术亦非根治性手术，容易出现复发。因此脊髓空洞症需要长期间歇性治疗，并且要定期到医院随访复查。
预后与潜在病因、神经功能受损程度、脊髓空洞位置、范围以及术后有无出现并发症有关。通过系统治疗，多数患者疼痛感觉可得到改善，肌肉萎缩不再进展，但引起的感觉障碍通常治疗效果不佳，可能会对正常的生活质量造成影响。
