肾盂输尿管连接部梗阻狭窄，首先要做筛查性质的检查，如B超可发现肾积水、肾输尿管扩张等，是首选的检查方法。X线检查，腹部平片可了解肾轮廓大小，对X线阳性结石可明确诊断。
具体部位、程度不明确可做尿路成像，可以通过CTU或者核磁逆行造影经过膀胱输尿管逆行插管逆行注入造影剂，使输尿管、肾盂显影，从而发现狭窄部位与狭窄程度。利尿性肾图对明确早期病变、判断轻度肾积水是否需要手术治疗有帮助。
肾盂测压试验，测定肾盂及膀胱的压力差可作为肾脏梗阻的指标。另外尿常规，可能有镜下血尿，若合并感染时有脓细胞，尿培养可有致病菌。
