微创手术可以治疗绝大多数的肾结石。肾结石的微创手术治疗分为两大类，一是经皮肾镜碎石取石术，另一类是输尿管软镜下钬激光碎石术。两者各具特色，总体而言，经皮肾镜碎石取石术是一种有效的治疗大结石的方法。输尿管软镜下钬激光碎石术是一种安全有效的手术，一般结石较小，仅处理直径小于2cm的结石。
也有少数患者因结石位置极差而无法通过经皮肾镜或输尿管软镜到达结石位置的，可能需要腹腔镜手术或者开放手术。此外，如果肾有先天畸形或之前做过开放手术，肾的解剖特征发生了变化等，有可能导致微创手术失败。
总之，微创手术只能治疗本次肾结石，要预防结石复发，还需要根据具体病人具体原因个体化预防治疗。
