先天性心脏病根据类型不同，所产生的影响各不相同。如果是肺血增多型先天性心脏病，除了会对心脏本身造成影响之外，还可能会影响到瓣膜返流、使心脏扩大等。如果是肺减少型先天性心脏病，影响也会比较严重，容易出现缺血，可能会直接影响中枢神经系统的发育、脑部发育。先天性心脏病的并发症有心力衰竭、肺炎感染性心内膜炎、脑血管意外、心律失常、猝死等。
先天性心脏病多数是胚胎发育时期，心脏大血管形成障碍或者发育异常所引起，目前的发病原因较为复杂，可能和环境因素、遗传因素、妊娠期吸食毒品、酗酒、吸烟等有关。
