做支气管镜检查是有一定风险的。包括病人可能对麻醉药品的过敏，也有可能会导致发热、咳嗽、感染、气管的痉挛，有可能会导致心里紧张、心动过速、血压升高。
因为做支气管镜检查的时候都需要相关的麻醉，所以有的人可能会对麻药过敏，这种情况一般可以先做皮肤过敏实验，看看有没有过敏反应。尽可能的减少过敏的可能。在支气管镜进入咽喉、气管的时候，有可能对黏膜产生损伤，刺激局部的黏膜而产生声带水肿，气管痉挛等。有的人心里紧张，有可能会诱发心动过速和高血压，这种情况可以使用相应的药物进行控制。而操作不当还有可能会导致气管出血、气胸、支气管胸膜漏、食管漏等。不过这些风险都是相对比较小的，检查前医生会进行全面评估。
