鼻窦炎头疼首先要找到引起头疼的原因。大多数鼻窦炎患者头疼的原因是鼻窦内脓性分泌物的储留，造成鼻窦黏膜和骨质的刺激，出现头面部的胀痛或闷痛。通过规范的药物治疗，包括鼻喷激素药物、口服敏感抗生素、鼻部盐水冲洗等方法，控制炎症后，头疼症状可逐渐缓解。
如果上述药物治疗无效或症状反复发作的情况下，也可以选择手术治疗，彻底清除鼻窦内的病变，扩大鼻窦窦口，恢复正常引流功能，头疼的症状往往在术后会很快缓解。
如果头疼非常剧烈，同时伴有恶心、呕吐或眼眶胀痛，甚至眼睑下垂、视力下降等症状时，要想到可能已经出现了鼻窦炎的眶或颅内的并发症，此时应尽早手术，保护鼻窦周围重要器官的功能。
