治疗三叉神经痛手术方式主要有三叉神经微血管减压术和经面部皮肤卵圆孔穿刺微球囊压迫术。在药物治疗效果不佳情况下可以选择手术治疗。
三叉神经微血管减压术是在显微镜或者神经内镜辅助下的开颅微创手术，通常在耳后进行开一个小切口，颅骨上开一个小洞，找到三叉神经的发出部位，找到压迫三叉神经的血管，在这根血管与三叉神经间放置一柔软的棉片加以隔离。经皮卵圆孔穿刺微球囊压迫术是在颜面部进行穿刺，进入卵圆孔，对三叉神经的神经节进行压迫，来缓解病人的疼痛。
除此以外，还可以通过射频消融术和甘油注射术以及放射治疗等来进行治疗。
