嗜酸性粒细胞偏高最常见的原因是过敏，可能是机体接触到了过敏原，如花粉、尘螨等，也可能是某些药物或感染激发的过敏，常见于一些变态反应性疾病，如支气管哮喘、荨麻疹等。在一些卫生条件不好的地区，寄生虫也是引起嗜酸性粒细胞升高的重要原因。一些肿瘤性疾病也可引起嗜酸性粒细胞的升高。
一些血液系统疾病，如慢性粒细胞性白血病、慢性嗜酸性粒细胞性白血病，也可以因骨髓造血异常导致嗜酸性粒细胞异常升高。少数患者嗜酸性粒细胞比值显著升高，伴有发热、喘憋、腹泻、腹痛、关节肿痛等症状，这种情况多数为嗜酸性粒细胞浸润引起的嗜酸性粒细胞肺炎、肠炎等，需要及时到医院血液科就诊。
