神经官能症需要长期甚至终身的治疗，积极地配合医生进行心理治疗，必要时联合药物治疗，多可以达到良好的治疗效果。
心理治疗主要包括心理疏导，引导患者正确认识疾病、积极面对现实。行为治疗，通过系统脱敏法、厌恶治疗等方法，纠正错误的认知、行为。还有森田疗法等。药物治疗中常见的药物有抗抑郁药、抗焦虑药等。医生会根据患者不同的情况及阶段，选择不同的治疗方法。
除了配合医生的治疗，还需要为患者提供舒适、安静的生活环境，减轻生活压力，维持健康生活作息，均衡饮食，保证身体健康。即使治愈的患者，如果存在高危因素，建议每年定期复查。
