先天性心脏病一般在手术后不会复发。但先天性心脏病根据手术目的分为一期根治手术和姑息性手术，根治性手术可以使心脏的畸形得以矫正，这样就和正常人是一样的生理解剖的结构，多数患儿手术后可以恢复正常的生活。姑息手术的意义就在于可以暂时改善临床症状，为根治手术创造条件，在姑息手术后还需要进行二期手术。
还有一种情况是先天性心脏病矫治后，随着时间推移，手术缝线可能会出现部分掉落，造成新的残余瘘或者瓣膜缺损。另外，随着身体的长大，心脏负荷增大，心脏经过修补以后又出现新的关闭不全或者狭窄等问题，出现这样的情况需要再次手术治疗，但不属于复发的范畴。
