脉管炎后期并发症最常见的就是由于腿部血供不足出现的患肢活动度下降、溃疡、坏死等。患肢还会出现麻木、疼痛、皮肤发黑等症状。如果坏死的组织有大量的细菌繁殖，还会引起严重的感染。在脉管炎的后期，炎症还可以引起其他部位血管和组织出现病理改变，如心血管，常见的心血管病变有心肌梗死、肺栓塞、脑血栓等。除此之外，神经、肌肉、骨骼等部位由于缺血也会出现相应的病理改变。脉管炎导致的干性坏疽，如果发展为湿性坏疽，可能会有截肢的风险。
