肾盂癌的发生是一个复杂、多因素、多阶段的病理变化过程，有内在遗传因素，也有外在环境因素，常见的危险因素是吸烟和长期接触油漆、皮革、橡胶等化工产品。而且有研究显示，吸烟的人比不吸烟的人发病率高一倍。局部性的长期炎性刺激，如有大量肾结石反复刺激肾盂黏膜，以及反复感染性炎症，容易导致肾盂癌，引起肾盂癌的类型多为鳞状细胞癌或腺癌，恶性程度极高。其它可能的因素包括滥用止痛药、长期饮用含砷含量高的水和氯消毒水，以及大量摄入脂肪、胆固醇、油炸食品等，都会增加肾盂癌的发病率。
