肝内胆管癌晚期由于肿瘤的恶化程度较高，大多数的患者都会出现进行性加重的黄疸，表现为皮肤巩膜的黄染。还有超过一半的患者会产生肝区的疼痛不适感，并且这种疼痛持续不能缓解，对于很多早期的癌症患者的肝区也会有轻微的疼痛，但只是短暂性疼痛，很多患者往往会忽略这一点进而耽误最佳治疗时间，使病情恶化，大大影响到生活质量。晚期的肝内胆管癌患者还会出现营养不良，身体状况会日渐消瘦。肝内胆管癌晚期患者还有可能会肝功能衰竭，出现腹水等。
