在临床上胰腺囊肿通常包括非肿瘤性囊肿，如真性囊肿与假性囊肿；还有肿瘤性囊肿。
其中，对于假性胰腺囊肿，一般是由于继发于急性重症坏死性胰腺炎，因此没有真正的囊壁。该类囊肿在临床上手术的指征是在胰腺假性囊肿形成超过3个月以上，直径超过6cm无法缩小，且引起压迫胃的症状，此时可以考虑囊肿、胃或小肠内引流手术治疗，早期也可以采取抑制胰腺分泌的药物，在药物作用下使囊肿自行吸收。
对于胰腺真性囊肿多为先天性，还有一些肿瘤性的囊肿，在囊肿较小，患者无症状时密切观察即可。当长期存在有恶变的可能或直径超过3cm以上出现局部的压迫症状者，主张手术治疗。
