白塞病很难治愈，大多数患者病程较长，且容易反复发作。发作时症状的轻重与持续时间，具有较大的差异，有部分患者可自然缓解。
绝大多数白塞病患者预后良好，有眼病的患者可能会有视力下降，经过早期治疗后可明显改善，但若不及时治疗，则存在失明等严重的后遗症。本病还可累及中枢神经系统、肠胃道、心血管系统等。
白塞病主要治疗目的为控制现有症状、防止重要脏器损害以及缓解疾病的进程。具体治疗方法，还需根据患者的病情轻重程度以及受累范围而定。
