甲状腺功能亢进症初期的患者，经过合理的治疗，大多数的患者可达到痊愈的目标。甲亢患者根据具体情况，可选择包括抗甲亢药物治疗、放射性碘治疗(131I治疗)和手术治疗。大部分患者选择合适的治疗方案后，经过治疗，病情可得到缓解直至痊愈。
其中抗甲亢药物治疗是内分泌科常选的治疗方案，对绝大多数甲亢患者都适用，常见的不良反应包括肝功能受损、白细胞计数减少、过敏性皮疹。治疗过程为初始阶段、减量阶段、维持阶段。
通常经过规律的治疗，患者可以停药治愈。但也有部分的患者可呈慢性的病程，且病情起伏，经久不愈。有少数的患者因特殊原因，或未规律治疗会引起严重的并发症。
