甲减和甲亢如果不经过正规治疗，病症持续加重，都属于十分严重的情况，具体哪个更严重，需要通过患者的疾病表现以及病症的严重程度判断，并不能以疾病的名称判断病症的严重程度。甲亢长期得不到合理治疗，危害最严重的是心血管系统，可能会导致心脏扩大，出现心力衰竭。
另外在感染、创伤、手术、精神刺激等诱因下，可能出现甲亢危象，表现为高热、大汗、心动过速、呕吐、腹泻、谵妄，甚至心力衰竭、休克及昏迷等，病死率很高。而甲减的患者主要的表现是表情呆滞、对事物反应迟钝、食欲不振等，累及心脏可以出现心包积液和心力衰竭。
重症患者可以发生黏液性水肿昏迷，表现为嗜睡、精神异常，木僵甚至昏迷、低体温、心动过缓、呼吸和心力衰竭等，病死率同样很高。
