乙型肝炎病毒相关性肾炎目前还不能完全治愈，没有特效的治疗方法。可通过药物治疗来帮助控制病情，有一定的治疗效果。一般通常需要选择抗病毒药物治疗，并加用糖皮质激素，研究表明糖皮质激素不宜单独使用，且疗程不宜过长。另外要注意使用合适的免疫抑制剂类药物。如果没有禁忌症、且患者能耐受，可选用RAS抑制剂（ACEI/ARB类药物），控制血压、减少蛋白尿、保护肾脏。
除此之外，患者要注意休息并避免过度劳累，做到低盐饮食与优质蛋白饮食，水肿明显时可使用利尿剂。中医认为肝肾同源的，本病发生与肝脏病毒感染有关，因此，防治清除体内乙肝病毒并防止肾脏继续受损是治疗关键。
