脑炎通常病情较轻、诊断和治疗及时的脑炎，疾病痊愈后，不会再复发，且一般预后良好，不会留下后遗症，也不会影响患者日后的生活或工作。而有极少数人群，如糖尿病病人、艾滋病病人、正处于化疗期间的病人、体弱多病的老年人，容易得复发性脑炎或是慢性脑炎，是上述病人本身抵抗力低下，加上致病的病毒或细菌没有完全被清除干净，潜伏在体内，在一些诱发因素作用下，潜伏的致病微生物再次过度繁衍，脑炎就有可能会复发，加重患者病情。
