恶性胸腺瘤恶性程度较高，治愈的可能性相对较低。但具体还与肿瘤的分型分期、是否侵犯其他脏器及患者自身的身体状况等因素相关。其中I期、II期胸腺瘤经完全手术切除治疗后多预后很好，部分患者生存期可达到十年以上。III期胸腺瘤患者手术常需扩大切除，如能完全切除，预后则较好；如切除不完全，术后需辅助放化疗，则预后不佳。IV期胸腺瘤患者若发生血行转移、心包播散或淋巴结转移，多失去了手术的机会，一般预后很差。恶性胸腺瘤的危害性极大，且病因及发病机制尚不明确，因此及早治疗对于疾病的预后具有极为重要的意义。
