胆结石的形成非常复杂，任何造成胆汁排出不畅，或胆汁成分改变的因素，都有可能导致则胆汁内的胆色素和胆固醇沉积，形成结石。如不吃早餐、肥胖、糖尿病、年龄超过40岁、女性、长期肠外营养、妊娠、久坐、缺乏运动、胃切除术后、高脂肪高胆固醇饮食等等，都可能和胆结石形成相关。另外，先天性的胆管发育畸形，各种原因造成的胆道感染，也会增加胆结石发生的风险。结石形成于肝内胆管，则是肝内胆管结石，形成于肝外胆管，则是肝外胆管结石，形成于胆囊，则是胆囊结石。
