脑梗塞介入治疗是有风险的，部分患者可能在动脉介入术后出现神经功能缺损的症状。目前医疗水平可以将动脉介入术并发症的产生控制到很小的概率，动脉介入治疗属于微创手术，但也有造成创伤的可能，首先可能会出现伤口感染；其次，介入术中在动脉内穿行的导管，有可能会对动脉造成损害，形成动脉瘤，或者使动脉破裂出血，还可能导致血栓形成；再次，部分血管功能较差的患者可能在动脉取栓后恢复脑部血流的灌注，造成脑部血流再灌注损伤。根据损伤的脑部区域不同而产生不同的神经功能缺损后遗症。
