无痛肠镜和普通肠镜检查过程是一样的，区别主要在于是否给予静脉的麻醉。
1. 无痛结肠镜检查，一般是通过静脉麻醉的方式，由专业麻醉师评估患者的身体状况后，选择适合的麻醉方式，一般分为全麻和清醒镇静两种方式。检查过程中，麻醉师也会全程监护，保证患者的安全。 相对来说，无痛结肠镜检查过程患者比较舒适，尤其是全麻方式，患者是在无意识睡着的状态下完成结肠镜检查的。
2.而普通结肠镜检查过程中，患者是完全清醒状态的，由于结肠镜检查过程中要间断往肠腔内注气，充盈肠腔后才能更清楚的显示肠道黏膜病变，减少漏诊，所以少数敏感的患者，在检查过程中可能会有不同程度的腹胀、腹痛等不适感觉，尤其是年轻女性和体型偏瘦的患者。但大部分患者也是能够很好耐受普通结肠镜检查的。
