肝内胆管结石或钙化灶是由腹部超声或CT检查发现，这类病变多不需要治疗，但应根据影像检查结果、肝功能化验、以及结核甚至寄生虫等方面的检查做出综合判断。
若患者肝内胆管有结石或存在钙化灶，但患者无症状，可采取定期复查处理。
若发现结石或钙化灶位于重要的位置，其数量较多或成堆，可能会产生严重的不良影响。在行CT或核磁共振检查后判断病人的结石及钙化灶所在的部位、是否存在远端胆管扩张、是否合并肝脏肿瘤尤其是肝内胆管细胞癌等，再结合相关化验检查做出进一步的分析。目前针对此类疾病多采用观察，定期体检处理；个别肝内胆管结石或钙化灶病人需要手术或介入治疗。
