心肌肥厚生存期与病因、肥厚部位、程度以及治疗都有关系，很难笼统地说能活多久。
如果是高血压引起的心肌肥厚，通常心室肌表现为均匀增厚，增厚的程度不是非常严重，通过规范的治疗，控制好血压，基本对生存期没有过多的影响。对于原发性肥厚型心肌病，病情较轻的可能没有任何症状，平时生活不会受到影响，积极用药物控制疾病进展，寿命不会受到影响。如果病情比较严重，已经出现了胸憋、胸痛、心悸、气紧、呼吸困难，生存的时间就有限了，可能仅数年。合并流出道梗阻的肥厚型心肌病患者存在猝死的风险；出现心力衰竭的心肌病患者五年存活率不到50%。
