胃肠道间质瘤手术后病理需要根据肿瘤大小和核分裂数，并参考肿瘤部位和是否破裂四个因素进行危险度分级，分为极低危、低危、中危和高危。极低危、低危不需要服用靶向药物；中危建议服用靶向药物1年，高危建议服用靶向药物3年。一线的靶向药物为酪氨酸激酶抑制剂，一种小分子蛋白激酶抑制剂，它具有阻断一种或多种蛋白激酶的作用，针对间质瘤的病因靶向杀伤，手术后服用药物，可减少病情复发以及转移的几率，还可以控制病情进一步发展，是目前最成功的靶向药物之一。
