慢性尿道炎根除的方法可通过以下几方面：1.明确感染性质，寻找和排除诱因。2.在医生的指导下使用抗菌药物来进行治疗，还要持续到症状消失，直到尿细菌转阴后两周。3.多饮水，增加排尿量。4.注意休息，在急性期避免同房，必要时夫妻双方同治。5.手术治疗。主要针对于某些存在器质性病变的人群，比如尿道狭窄、前列腺增生症后、尿道瓣膜等人群，可充分抗感染治疗后，采取手术治疗解除梗阻，疏通尿道；对于尿道有异物的人群，可在抗感染治疗的同时，采取手术治疗；脓肿病人也要充分引流脓液等。
