微创碎石对肾脏的伤害，要根据具体的治疗手段判断。微创碎石有体外冲击波碎石、微创手术碎石。
（1）体外冲击波碎石：体外碎石具有创伤小、恢复快等优点，但需要严格掌握冲击波碎石次数和能量，体外碎石对肾脏的影响较小，无需过度担心，但如果冲击波碎石次数过多、能量过大，可能会导致肾实质的萎缩，甚至肾周血肿等并发症。
（2）微创手术碎石包括输尿管镜碎石、经皮肾镜碎石等。若采取的是输尿管镜碎石，需经过自然的腔道，对肾脏的损伤较小。若采用经皮肾镜手术，要建立经皮肾通道处理结石，短期内对肾脏具有一定的损伤，但一般术后1个月左右基本恢复正常。若术中或是术后肾脏大出血，需要进行介入止血，可能会加重对肾脏的损伤。
