甲状腺乳头状癌的病因，其实就是甲状腺癌的病因。目前恶性肿瘤疾病的病因尚不明确，没有确定的病因，但是有与肿瘤疾病相关的影响因素。
1、碘。碘是合成甲状腺激素的必要原料，碘缺乏会导致甲状腺激素合成减少，进而刺激促甲状腺激素升高，造成甲状腺滤泡增生肥大，增加甲状腺癌的发病率。同时高碘饮食也可能会增加甲状腺癌的发病率。
2、放射性射线，有实验表明，放射性射线会破坏甲状腺促使甲状腺发生癌变；
3、遗传因素；
4、基因突变，原癌基因和抑癌基因的激活；
5、地域、种族、年龄、性别等其他因素。
总的来说，肿瘤疾病的发生时是多种因素共同作用的结果。
