普通肠镜和无痛肠镜的主要区别，如下：
无痛肠镜在做检查前会对患者进行静脉麻醉，患者整个过程处于睡眠无痛状态；普通肠镜患者在检查过程中处于清醒状态，肠镜检查属于侵入性检查方式，普通肠镜在检查过程中会导致患者出现不适感和紧张的情况，在结肠镜经过直肠、乙状结肠交界处或结肠肝曲时，患者会有明显的牵拉性疼痛。此外无痛肠镜在价格上会贵于普通肠镜。
对肠镜检查不耐受或对疼痛比较敏感的患者，可以考虑选择无痛肠镜检查。但如果有严重的心肺疾病，麻醉评估认为患者无痛肠镜检查风险大，不适宜行无痛肠镜，则只能行普通肠镜检查。
