单纯的双侧卵巢多囊样改变，无月经改变，可以观察，不需要治疗；如果已确诊多囊卵巢综合征，那么因多囊卵巢综合征的病因尚不清楚，一般认为和下丘脑垂体卵巢轴功能异常、肾上腺功能紊乱、遗传、代谢等因素有关。导致卵泡都处在早卵泡期，不能长大成熟，更不能排卵，导致月经紊乱或闭经。因治疗目的不同，治疗方案也不同。
近期的目标为调整月经周期、治疗多毛和痤疮，控制体重，多用短效口服避孕药，有生育要求的女性给予促排卵治疗；远期目标是预防糖尿病、子宫内膜癌、肥胖及心血管疾病，因此多囊卵巢综合征的治疗，需要结合病史以及需求来制定具体方案，另外，多囊卵巢综合征是一个需要长期管理的疾病，不能彻底治愈。
