肥厚型心肌病的治疗包括药物、消融术、外科手术以及植入除颤仪。
应用相关药物可以减轻不适症状，常用的药物有β受体阻滞剂、钙通道阻滞剂、抗心律失常药物等。对于症状明显以及存在左心室流出道梗阻的患者来说，β受体阻滞剂可作为一线治疗药物，但是要注意患者的心室率。
晚期肥厚型心肌病患者如果药物治疗无效，可以考虑行射频消融术或者外科手术切除部分肥大的心肌以解除症状，部分患者也可以考虑植入双腔永久性起搏器以解除梗阻的情况。
除此之外，还需要控制饮食、情绪等方面。
