胆管结石的并发症有急性胆管炎、急性梗阻性化脓性胆管炎、肝脓肿、胆源性胰腺炎、胆汁性肝硬化、肝功能衰竭等等。
胆管结石这种疾病由于长期结石的刺激，可能造成局部胆管的炎症，从而出现急性胆管炎的相应临床症状。
而急性胆管炎进一步加重后，可导致患者出现急性梗阻性化脓性胆管炎，在前者临床症状的基础上，还会出现神经精神系统症状以及感染性休克等。
一旦细菌沿胆管感染后，可造成局部细菌性肝脓肿的形成。而如果结石嵌顿于胆总管壶腹部时，由于堵塞胰腺的排出通道，可造成胆源性的胰腺炎。
一旦胆管结石造成的梗阻长期存在，造成肝功能损伤继而进行性加重后，可导致肝功能衰竭等严重病情。
