脸上出扁平疣，是因为局部的上皮细胞感染了人乳头状瘤病毒。
人乳头状瘤病毒主要对上皮细胞有比较强的亲和性，感染人体以后主要累及皮肤和黏膜的上皮细胞。其中有很多不同的亚型，分属皮肤低危型的人乳头状瘤病毒，主要侵犯皮肤的上皮细胞，导致上皮细胞异常增生，引起的疾病就是扁平疣、寻常疣。
乳头状瘤病毒感染的原因，可能是局部的皮肤发生了轻微损伤，屏障功能被破坏，不能有效的抵抗病毒的感染。如果正好与患有这种疾病的患者发生了密切的接触，病毒就会趁机侵入而引起感染。
