由于每个人智齿的位置、方向不同，所以智齿不拔的危害要根据实际情况来确定。如果智齿萌出位置、方向和形态都是正常的，而且不影响咬合功能，这时可以保留，对口腔没有危害。但是如果智齿长歪了，就需要及时拔除，以免导致反复发炎，引发智齿冠周炎的出现，导致牙龈肿痛，严重的会影响日常进食。
另外，如果智齿长歪后没有及时拔除，还可能会导致邻牙龋坏，由于食物残渣经常在牙缝中嵌塞，容易滋生细菌，导致龋齿，影响正常的咬合功能。斜位阻生智齿会顶坏前面好牙，低位埋伏阻生智齿可能造成囊肿等危害。
