扁平疣的病情较轻，通常可自行消退或在积极治疗后达到治愈的状态，一般对身体的影响并不大。但是扁平疣会传染，可以通过自体传染，还可传染给其他人。由于该病的传染性，需要与他人进行隔离，所以会对心理造成很大负担，容易导致抑郁症的发作。如果治疗的不及时，可能会使数量越来越多，从而影响到面部美观。
扁平疣的患者，可以遵医嘱选择外用药物治疗或内用药物治疗，比较常用的药物为维A酸类药物、水杨酸类药物等，还可联合中医治疗，必要时也可采取手术治疗。
