头痛与睡眠障碍有着一定的关系，但是并不是所有头痛，都是由于睡眠障碍引起的病变表现。
在患者出现睡眠障碍时，无论是睡眠时间过长还是睡眠时间过短，在觉醒以后，都可能出现头痛的症状。而头痛并不都是睡眠障碍引起的，也可能是由于患者出现高血压病、偏头痛、脑梗塞、短暂性脑缺血发作、脑出血、颅脑肿瘤、颅脑外伤、感冒、颈椎病等器质性疾病导致的症状。在患者出现头痛的病情时，需要及时进行头部CT或者核磁共振检查、血压检查、颈椎核磁共振检查、血液化验检查等，来明确病因，针对病因进行治疗。
