自身免疫性肝病的诊断非常复杂，以下几个方面可以作为参考：1.如果患者转氨酶及lgG升高，出现球蛋白异常，病理提示界面性肝炎和浆细胞浸润，评分标准大于15分，那么患者可能是自身免疫性肝炎。2.如果患者体内碱性磷酸酶大于正常值的两倍以上，抗线粒体2型阳性，病理提示胆管呈肉芽肿改变，那么可能是原发性胆汁性肝硬化。需要注意的是，以上提到的几点，只要发现其中两条就能确诊。3.如果患者在检查的过程中，影像学提示胆管有明显的狭窄或堵塞情况，那么需要考虑原发性硬化胆管炎的可能。
