卵巢囊肿手术后的复发率因人而异。囊肿手术后是否会复发，与囊肿的性质有直接关系、也与手术时采取的具体方式有关。因普通的盆腔内慢性感染性疾病引起的输卵管卵巢囊肿，手术治疗以后一般都不会复发。因子宫内膜异位而引起的卵巢囊肿，如果采取单纯的囊肿摘除手术，术后的复发率非常高；如果采取了根治性的手术，将病变的卵巢以及子宫都全部清除，术后一般就不会再复发。另外，发生在卵巢的黏液性囊腺瘤，保守手术后也有复发的可能性。
