黄体功能不全以及有黄体早衰的人更容易孕酮低。孕后如果孕酮低，可能引起胎儿发育不良，应去医院详细检查，明确诊断。
孕酮低可能是因为黄体功能不全引起黄体分泌孕酮不足，而黄体过早衰退引起子宫内膜分泌功能减弱，孕卵着床变得困难以及有早孕流产的情况。黄体功能不全一般与垂体分泌LH，FSH减少，以及垂体催乳素分泌过多或过少有关；或与雌孕激素之间比值的不协调等也可能使孕妇孕酮低，引起流产的几率会增加。若有腹痛及出血，在隔天监测hCG如果翻倍好，但是孕酮值较低，就要在医生指导下用孕酮保胎治疗，一般是能够恢复正常的。
