临床上所说肛门脓肿一般指的是肛周脓肿，肛周脓肿与肛瘘是既有区别，也有所联系，具体如下：
1、肛周脓肿属于感染的急性期，而肛瘘大多数情况下属于感染的慢性期。其实，现在还有一种观点，是说肛周脓肿和肛瘘属于同一种疾病的不同期。
2、肛周脓肿的临床症状主要是红、肿、热、痛，而肛瘘的临床症状主要是发生在外口间断性的出现肿胀、疼痛、破溃、流脓。
3、肛周脓肿的体征主要是在发病部位出现红肿的包块，有时候按压有波动感。而肛瘘的体征，主要是在肛周出现外口间断性的分泌脓液或者粪便。
如果肛周脓肿反复发作，极有可能会形成肛瘘，需要手术治疗。
