孕酮有所降低主要原因包括黄体功能不足、先兆流产以及内分泌系统的疾病，如早产、卵巢发育不全、月经不调、不孕症等。当有先兆流产迹象，如腹痛、阴道流血等症状时，则孕激素、hCG水平就有可能会出现下降的趋势；如果黄体功能不足，在整个的生理期内，会出现月经周期提前和缩短现象，孕激素水平也会出现偏低的情况；存在内分泌系统的疾病，如甲状腺功能减弱等其他一些内分泌疾病，均会对垂体内分泌的调节性腺轴造成一定影响，也会致使孕酮水平下降。
