宝宝胃食管反流病的症状轻重不一，与反流的强度、持续的时间、有无并发症以及患者年龄有关。
新生儿和婴幼儿以呕吐为主要表现，多发生于进食后，有时在夜间或空腹时，年长儿以反胃、反酸、嗳气等症状多见。
其次是反流性食管炎的症状，常见症状如胃灼烧感，见于有表达能力的年长儿；咽下疼痛，婴幼儿表现喂奶困难、烦躁、拒食，年长儿述说咽下疼痛；呕血和便血，严重的反流性食管炎可发生缺铁性贫血、营养不良。胃食管反流可引起呼吸道感染；小婴儿或早产儿可致窒息和呼吸暂停。其他相关症状包括声音嘶哑、中耳炎、反复口腔溃疡、龋齿等等。
