婴儿消化不良的治疗方法，取决于引起消化不良的原因而定。
1、婴儿消化不良如果是胃肠蠕动功能减弱导致，可以服用促进胃肠动力的药物治疗。
2、婴儿消化不良如果是肠内菌群失调导致，可以服用调理肠道菌群的益生菌类药物治疗。
3、婴儿消化不良如果是喂养方式不当导致，母乳喂养时要适当的延长喂养时间或采用少食勤食的方法，奶粉喂养时一定采用适合宝宝的奶粉并按合适比例冲调，喂奶过后，要将婴儿竖立起来，轻轻拍打婴儿的后背，将婴儿胃里面的空气排出，同时家长也可以顺时针的按摩婴儿的腹部或辅以推拿，对缓解消化不良有很大的帮助。
