卵巢囊肿不一定会发生癌变，且总体癌变率较低。生理性囊肿不会发生癌变，如滤泡囊肿和黄素囊肿，只需要定期复查；炎性囊肿，比如盆腔炎、附件炎引起囊肿也不会癌变。病理性卵巢囊肿有一定的恶变几率，数据显示在1％-10％之间。有的卵巢囊肿，检查出来的时候，它有可能就是早期卵巢癌的一种。卵巢囊肿一旦癌变，就有可能引起并发症，如感染、蒂扭转出血或破裂，从而可引起反胃、呕吐、发烧和腹部剧痛，需要积极治疗，否则后果不堪设想。
