卵巢囊肿的检查方法包括妇科的双合诊检查、三合诊检查。还可以通过超声检查。另外还包括血液的免疫生化学指标检查。妇科检查是指医生用一只手放到患者的腹部,另一只手置于阴道后穹窿部位,通过双手的触摸、按压来判断囊肿的性质、部位以及活动度,是否出现按压痛。通过超声检查可以了解卵巢附件区的无回声区,如果发现有分隔的无回声区,考虑是子宫内膜异位囊肿,也叫做巧克力囊肿。如果通过血常规化验检查,结果显示白细胞中的中性粒细胞增高,考虑卵巢子宫内膜异位囊肿。