卵巢囊肿是否会自己消失，需要具体问题具体分析。
卵巢囊肿分为生理性卵巢囊肿和病理性卵巢囊肿，一般情况下，生理性卵巢囊肿是不需要特殊治疗的，是可以自行消失的。而病理性卵巢囊肿是不会消失的，只有在一定的干预措施下才有可能缩小。病理性的卵巢囊肿又分为良性卵巢囊肿和恶性卵巢囊肿，良性的卵巢囊肿有可能通过药物治疗而缩小，并且不会对人体产生影响。而恶性卵巢囊肿则是需要手术治疗，甚至需要放化疗。部分卵巢囊肿可能受雌激素水平的影响，在绝经后激素水平降低，会使卵巢囊肿的体积变小，而在雌激素水平较高的情况下，卵巢囊肿是会继续增长的。
